L'industrie cosmétique recherche en permanence la compréhension des effets d’un produit pour formuler de nouvelles allégations. Pour cela, il est important de connaitre les impacts sur le métabolisme (métabolomique) et sur l'activité protéique (protéomique). Par ailleurs, 
la caractérisation des ingrédients est importante pour connaître les principes actifs.
Nous sommes à votre écoute pour discuter de nos méthodes analytiques. Contactez nous pour toute information afin de nous faire savoir comment vous aider dans vos projets.
Explants de peau, peau reconstruite, punches, fibroblastes, mélanocytes, kératinocytes…, sérum, strips, écouvillons, cheveux.
Cette méthode permet de comparer qualitativement et quantitativement les protéomes de différents individus, incluant ou non le microbiote. Typiquement cette technique peut être utilisée pour comparer deux états, par exemple sain vs pathologique ou pathologique vs traité, et permet ainsi d'identifier des biomarqueurs dont la présence ou la teneur témoigne d'un état physiologique donné.
Elle consiste à comparer les profils LC-MS des échantillons et à en estimer l'aire des pics des différents peptides. Cette aire est rapportée à celle acquise pour les mêmes peptides dans un échantillon de référence et ainsi on peut quantifier relativement la teneur en protéine.
Lors du même essai, en analysant les données acquises par LC-MS/MS, on effectue l'identification des protéines impliquées en comparant les masses et spectres des peptides observés à des bases de données de protéines.
Les données de quantification relative des protéines identifiées sont ensuite traitées par le module CORAVALID qui consiste en une analyse complémentaire des données, mettant en évidence les processus biologiques, fonctions moléculaires, composantes cellulaires et voies métaboliques et signalétiques liés aux protéines analytes.
Ceci permet de mettre en évidence les effets positifs comme négatifs, et de pouvoir développer un argumentaire (claims) qui est propre au produit testé.
Cette approche est par ailleurs particulièrement adaptée à l’étude de la peau incluant son microbiote, car c’est la seule qui permet d’atteindre simultanément l’hôte et le microbiote, et qui permet de mettre en évidence le niveau fonctionnel des effets générés.
Les effets, positifs et négatifs sont appréhendés globalement de manière non ciblée, la bioinformatique permet de comprendre les voies métaboliques impactées
Comparaison de cellules ou de biopsies ou autres prélèvements cutanés ayant été traités par un actif ou un placebo par protéomique haute résolution et bioinformatique associée, permettant de générer un rapport de biologie sur les claims utilisables.
L’ensemble des effets du stress sur le métabolisme est appréhendé avec un focus sur les protéines les plus sensibles.
Comparaison de cellules ou d’écouvillons de peau ou autres prélèvements cutanés ayant subi un stress (UV, pollution, fumée de cigarette…) par protéomique haute résolution et bioinformatique associée, intégrant un profil d’oxydation sur 18 réactions redox des 10 acides aminés sensibles, et un indice d’oxydation OxDeep. Un rapport de biologie sur les effets globaux du stress est généré.
La phosphorylation des protéines est un mécanisme crucial dans de nombreuses régulations cellulaires et fortement impliqué dans pratiquement tous les processus physiologiques et pathologiques tels que la transduction du signal, la prolifération cellulaire, la différentiation, l’apoptose ou encore le métabolisme. Les processus de signalisation impliquant la phosphorylation sont souvent dérégulés lors de pathologie ou de stress.
Comparaison de cellules ou de biopsies ayant subi un traitement ou un placebo par protéomique et phosphoprotéomique haute résolution et bioinformatique associée, permettant pour chaque protéine phosphorylée de connaître ses sites de phosphorylation et ses modifications d’abondance de phosphorylation. Un rapport de biologie sur les effets sur le protéome et le phosphoprotéome est délivré.
La peau est un organe complexe qui maintenant peut-être défini comme ayant une partie humaine et une partie microbienne. Cette partie constitue le microbiote de la peau, et est très réactive aux effets de l’environnement. Elle peut être étudiée avec les méthodes de génomique, protéomique, métabolomique.
Suivi par PCR quantitatives de genres majeurs, par exemple Staphylococcus sp. (Firmicutes), Corynebacterium sp. (Actinobacteria), Propionibacterium sp. (Actinobacteria) . D’autres cibles sont possibles en fonction des effets espérés. Le niveau de réponse : Il est du type « le produit a un effet/n’a pas d’effet sur les genres testés »
Etude métagénomique comparative du microbiome de la peau par NGSequencing 16S rDNA. Le niveau de réponse : « un rapport qui indique si le produit modifie/ne modifie pas la composition semi-quantitative et la diversité du microbiome »
Etude métaprotéomique comparative du microbiome et de la peau par quantification relative LC-MS/MS « shotgun proteomics » et analyse bioinformatique/ biostatistique HolXplore. Le niveau de réponse : “ un rapport qui précise les effets du produit sur les fonctions et les interactions du microbiome et de la peau ”
Une identification rapide et efficace des métabolites est actuellement un point critique dans le processus de découverte de nouveaux ingrédients. Le but est d'effectuer une identification structurale rapide et une caractérisation complète des métabolites majeurs et mineurs de vos principes actifs en une seule analyse.
La démarche se base sur la recherche et la caractérisation non ciblée des molécules produites par l'administration d'un traitement sur la peau. Ces molécules sont alors caractérisées par leur masse exacte, leur pattern isotopique pour déterminer leur formule brute et le suivi du pattern de fragmentation pour déterminer sa structure.
La quantification d'un ingrédient protéique en milieu biologique par méthode ciblée (Multiple Reaction Monitoring) est actuellement un point essentiel pour vérifier qu'il arrive à une dose suffisante à la cible.
La démarche se base sur la quantification par méthode ciblée de spectrométrie de masse. Cela permet de suivre la quantité de molécules médicamenteuses dans l'organisme à un instant donné, ainsi que celle des métabolites déterminés auparavant.
La connaissance et la maitrise des impacts au niveau physiologique des ingrédients, sont des éléments importants dans la création de cosmétiques.
Que ce soit l'étude des perturbations du profil métabolique (lien vers métabolomique) d'organisme soumis à une molécule thérapeutique ou encore les variations des profils d'expression protéiques (toxico-protéomique), il est possible de suivre, identifier et quantifier ces modifications par analyse différentielle des spectres LC-MS/MS.
La démarche est basée sur la comparaison d'échantillons positifs (traités) à des échantillons négatifs (non traités). Cette méthode associée à la comparaison à des banques de données permet d'accéder à l'identification des composés différenciant des profils protéiques ou métaboliques et à leur quantification relative.
Phylogene, créée en 1999, est une société de services en biotechnologie utilisant les techniques de génomique, transcriptomique, protéomique, métabolomique et bioinformatique associée pour des applications d’identification et d’authentification ou pour mettre en évidence des effets biologiques.
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